Madhuparna Nandi a obtenu un doctorat en Biochimie (Immunologie)à l’Institute of Post Graduate Medical Education & Research, Kolkata, India. Son domaine de spécialisation était l’immunologie des maladies infectieuses (Hépatite B), et plus particulièrement le suivi longitudinal des points communs et divergences entre les differents stades de la maladie chez les patients, au cours de l’évolution naturelle de l’infection.

Elle a approfondi son expertise en immunologie virale grâce à une invitation spéciale pour une formation à l'Université du Maryland, à Baltimore (États-Unis). Elle a ensuite poursuivi ses recherches en immunologie humaine pendant quatre ans et demi, d'abord à l'Université de Sherbrooke, puis à l'Université d'Ottawa.

Ses premières recherches postdoctorales portaient sur la leucémie lymphoblastique aiguë à cellules T et l'étude des progéniteurs néoplasiques transformés et de la rémission de la maladie par thérapie par transfert adoptif de cellules T. Lors de ses secondes recherches postdoctorales, elle a travaillé sur l'immunothérapie adoptive par cellules CAR-NK dans le myélome multiple.

Depuis mai 2023, elle travaille comme chercheuse au sein de l'unité d'analyse des données, d'abord pour l'équipe de développement, puis pour l'équipe des sciences cliniques de CellCarta Biosciences (anciennement Caprion), où elle occupe le poste de scientifique principale.